海貍西浦聯(lián)合實(shí)驗室蛋白質(zhì)組學(xué)探索2024:譯著(zhù)+綜述
海貍西浦聯(lián)合實(shí)驗室蛋白質(zhì)組學(xué)探索2024:譯著(zhù)+綜述
西浦慧湖藥學(xué)院-海貍生物聯(lián)合科學(xué)實(shí)驗室于2022年合作建設,專(zhuān)注于磁珠技術(shù)在蛋白質(zhì)組學(xué)和細胞及基因治療領(lǐng)域的深度開(kāi)發(fā)與應用,致力于為生物醫藥和檢測行業(yè)提供全方位、高品質(zhì)的技術(shù)服務(wù),目前已完成兩名碩士生的聯(lián)合培養,并有兩名博士生在讀。
2024年度聯(lián)合實(shí)驗室的主要學(xué)術(shù)成果介紹如下:
譯著(zhù)《系統生物學(xué)中的蛋白質(zhì)組學(xué)》
2024年8月,由王宜強博士、張慶華博士、王牧博士聯(lián)合主譯、聯(lián)合實(shí)驗室徐明明博士、Shining Loo博士參與翻譯的《系統生物學(xué)中的蛋白質(zhì)組學(xué)(方法與實(shí)驗指南)》順利完成并由科學(xué)出版社出版。
本書(shū)是Springer/Humana出版社出版的《分子生物學(xué)方法》(Methods in Molecular Biology)系列叢書(shū)之第2456卷,主要介紹了基于質(zhì)譜分析的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在系統生物學(xué)研究中的應用,著(zhù)重于技術(shù)方法,輔以相關(guān)理論及注意事項。在研究對象方面,涵蓋了目前生物或醫藥研究領(lǐng)域常用的細菌、真菌、植物、動(dòng)物和人類(lèi)等物種;包括了組織、細胞、細胞器、分子等不同層面的蛋白質(zhì)組學(xué),還包括了健康(生理)或疾?。ú±恚顟B(tài)下蛋白質(zhì)組的變遷。在研究過(guò)程方面,從起初的樣本制備(甚至更早期的植物樣本培育),到中間的樣本處理和檢測、數據采集和分析,再到最后的深度挖掘,給讀者一個(gè)全鏈條的逐步操作指南。對于一些重要的操作環(huán)節,則通過(guò)“注釋”的方式進(jìn)一步拓展,幫助更深入地了解相關(guān)步驟的關(guān)鍵或其理論支撐。本書(shū)除作為蛋白質(zhì)組學(xué)專(zhuān)業(yè)人員或質(zhì)譜領(lǐng)域技術(shù)人員的操作指南外,還可幫助其他專(zhuān)業(yè)領(lǐng)域的人員如何通過(guò)該技術(shù)解決本專(zhuān)業(yè)遇到的技術(shù)問(wèn)題。本書(shū)可供從事生物、醫學(xué)及其他生命科學(xué)相關(guān)基礎、轉化及應用研究的科研和教學(xué)人員及在這些領(lǐng)域接受培訓的學(xué)員參考閱讀。
綜述《N-糖蛋白富集材料研究進(jìn)展》
2024年12月底,由程麗作為第一作者,在徐明明博士、王宜強博士和黃明賢博士聯(lián)合指導下,聯(lián)合實(shí)驗室在Analytical and Bioanalytical Chemistry雜志發(fā)表綜述“Advances in the development of N?glycopeptide enrichment materials based on hydrophilic interaction chromatography”,總結了基于親水相互作用色譜的 N-糖蛋白富集材料研究進(jìn)展。
研究背景:N-糖蛋白組學(xué)研究
生物體內約50%的蛋白可發(fā)生糖基化,目前許多疾病診斷的標志物及治療的靶標也都是糖蛋白。近年來(lái)以質(zhì)譜為核心的糖蛋白組學(xué)成為解析糖鏈、修飾位點(diǎn)和蛋白的主要技術(shù),然而,復雜生物樣品(血清、血漿、尿液和細胞)中糖蛋白的低豐度和低電離效率限制了分析的靈敏度。此外,共存物質(zhì)(包括未修飾的肽段、表面活性劑、鹽類(lèi)和其他雜質(zhì))會(huì )在質(zhì)譜分析中強烈干擾目標信號,因此,在質(zhì)譜分析前對糖肽進(jìn)行富集至關(guān)重要。針對N-糖蛋白的富集方法有很多,比如凝集素富集、硼酸親和富集、液相色譜 HILIC 富集、肼化學(xué)富集等,不同的富集方法,富集原理各有不同,各有優(yōu)缺點(diǎn),其中HILIC 應用最為廣泛。
成果總結:N-糖蛋白富集純化材料
N-糖蛋白具有親水性可以和 HILIC 色譜柱親和結合,現有研究表明幾種親水配基(包括L - 半胱氨酸、谷胱甘肽、L - 精氨酸、二氧化硅、兩性離子等)均可以從復雜臨床樣本如人血清中分離純化糖蛋白。目前,研究人員已經(jīng)開(kāi)發(fā)出各種具有高比表面積、高親水性和高富集效率的材料(石墨烯基、金屬有機骨架材料MOFs、磁性材料、共價(jià)有機骨架材料COFs、聚合物和雜化材料等)。
金屬有機骨架材料和磁性親水材料MoS2-Fe3O4-Au/NWs-GSH結構示意圖
共價(jià)有機骨架和聚合物材料MCNC@Polymer@COF-MUBA結構示意圖
在各種親水性材料中,磁性納米材料脫穎而出。磁性納米材料因為具有磁響應性,可通過(guò)磁場(chǎng)對糖蛋白快速分離和檢測,大大降低了樣本前處理的時(shí)間,提供了更加靈活的操作方法。通過(guò)對磁珠表面進(jìn)行改性和功能化,還可以滿(mǎn)足特定的應用要求。同時(shí),納米磁珠具有較大的比表面積,對微量樣本的富集也有更好的效果。
據該綜述的指導專(zhuān)家之一黃明賢博士透漏,在該綜述匯總的關(guān)于糖蛋白純化策略基礎上,聯(lián)合實(shí)驗室徐明明團隊開(kāi)展了關(guān)于糖蛋白分離材料和方法的改進(jìn),取得良好效果,預期明年能將相關(guān)的研究成果公開(kāi)發(fā)布。
海貍生物致力于磁性納米材料的核心技術(shù)開(kāi)發(fā)及應用研究,成功開(kāi)發(fā)出多種高性能的親水配體磁珠用于生物樣本的富集(包含核酸、蛋白質(zhì)、小分子代謝物、真菌毒素、動(dòng)物活細胞等),廣泛應用于體外診斷、生物醫藥、動(dòng)物疫病控制、食品安全檢測、細胞及基因治療等領(lǐng)域。
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